Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTN1P12814 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms