Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPB41P11171 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPB41P11171 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPB41P11171 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPB41P11171 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EPB41P11171 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPB41P11171 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPB41P11171 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPB41P11171 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPB41P11171 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPB41P11171 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPB41P11171 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPB41P11171 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB41P11171 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB41P11171 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB41P11171 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB41P11171 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB41P11171 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB41P11171 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB41P11171 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB41P11171 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB41P11171 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB41P11171 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPB41P11171 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB41P11171 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB41P11171 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB41P11171 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB41P11171 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB41P11171 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB41P11171 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB41P11171 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB41P11171 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB41P11171 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB41P11171 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB41P11171 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EPB41P11171 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB41P11171 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB41P11171 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB41P11171 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB41P11171 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB41P11171 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB41P11171 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB41P11171 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB41P11171 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB41P11171 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPB41P11171 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB41P11171 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB41P11171 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB41P11171 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB41P11171 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB41P11171 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB41P11171 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB41P11171 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB41P11171 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB41P11171 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB41P11171 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB41P11171 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPB41P11171 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPB41P11171 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPB41P11171 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPB41P11171 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPB41P11171 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPB41P11171 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPB41P11171 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPB41P11171 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPB41P11171 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPB41P11171 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPB41P11171 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPB41P11171 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPB41P11171 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EPB41P11171 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41P11171 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41P11171 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41P11171 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41P11171 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41P11171 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41P11171 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41P11171 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41P11171 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41P11171 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41P11171 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41P11171 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41P11171 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41P11171 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41P11171 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41P11171 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41P11171 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41P11171 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41P11171 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41P11171 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41P11171 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB41P11171 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB41P11171 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB41P11171 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB41P11171 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB41P11171 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB41P11171 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB41P11171 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB41P11171 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB41P11171 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms