Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARBP10826 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARBP10826 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARBP10826 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARBP10826 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARBP10826 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARBP10826 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARBP10826 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARBP10826 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARBP10826 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RARBP10826 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARBP10826 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RARBP10826 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARBP10826 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARBP10826 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARBP10826 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARBP10826 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARBP10826 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARBP10826 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RARBP10826 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARBP10826 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARBP10826 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARBP10826 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARBP10826 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARBP10826 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARBP10826 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARBP10826 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARBP10826 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARBP10826 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARBP10826 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARBP10826 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARBP10826 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RARBP10826 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARBP10826 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RARBP10826 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARBP10826 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARBP10826 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARBP10826 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARBP10826 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARBP10826 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARBP10826 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARBP10826 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARBP10826 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARBP10826 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RARBP10826 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARBP10826 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARBP10826 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARBP10826 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARBP10826 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARBP10826 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARBP10826 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARBP10826 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARBP10826 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARBP10826 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARBP10826 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARBP10826 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARBP10826 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARBP10826 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARBP10826 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARBP10826 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARBP10826 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARBP10826 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARBP10826 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARBP10826 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARBP10826 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARBP10826 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARBP10826 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARBP10826 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARBP10826 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARBP10826 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARBP10826 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARBP10826 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARBP10826 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARBP10826 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARBP10826 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARBP10826 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARBP10826 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARBP10826 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARBP10826 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARBP10826 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARBP10826 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARBP10826 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RARBP10826 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARBP10826 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARBP10826 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARBP10826 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARBP10826 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARBP10826 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARBP10826 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARBP10826 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RARBP10826 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARBP10826 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARBP10826 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARBP10826 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARBP10826 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARBP10826 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARBP10826 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARBP10826 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARBP10826 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARBP10826 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms