Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRFP10586 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRFP10586 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms