Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC192P0DO97 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC192P0DO97 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC192P0DO97 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC192P0DO97 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC192P0DO97 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC192P0DO97 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC192P0DO97 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC192P0DO97 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC192P0DO97 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC192P0DO97 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC192P0DO97 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC192P0DO97 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC192P0DO97 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC192P0DO97 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms