Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf88P0DMB2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms