Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC166P0CW27 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC166P0CW27 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms