Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBBP0CG47 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBBP0CG47 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms