Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC4P0CG21 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC4P0CG21 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC4P0CG21 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC4P0CG21 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC4P0CG21 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC4P0CG21 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC4P0CG21 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC4P0CG21 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NHLRC4P0CG21 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NHLRC4P0CG21 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NHLRC4P0CG21 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NHLRC4P0CG21 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms