Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP1P09874 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP1P09874 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP1P09874 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP1P09874 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP1P09874 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP1P09874 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP1P09874 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP1P09874 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP1P09874 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP1P09874 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP1P09874 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP1P09874 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP1P09874 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP1P09874 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP1P09874 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP1P09874 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP1P09874 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP1P09874 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP1P09874 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP1P09874 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP1P09874 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP1P09874 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP1P09874 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP1P09874 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP1P09874 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP1P09874 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP1P09874 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP1P09874 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP1P09874 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP1P09874 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP1P09874 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP1P09874 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP1P09874 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP1P09874 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP1P09874 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP1P09874 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP1P09874 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP1P09874 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP1P09874 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP1P09874 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP1P09874 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP1P09874 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP1P09874 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP1P09874 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP1P09874 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP1P09874 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP1P09874 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP1P09874 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP1P09874 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP1P09874 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP1P09874 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP1P09874 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP1P09874 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP1P09874 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP1P09874 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP1P09874 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP1P09874 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP1P09874 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP1P09874 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP1P09874 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP1P09874 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PARP1P09874 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP1P09874 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PARP1P09874 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP1P09874 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms