Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP3P08254 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP3P08254 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP3P08254 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP3P08254 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP3P08254 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP3P08254 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP3P08254 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP3P08254 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP3P08254 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP3P08254 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP3P08254 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP3P08254 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP3P08254 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP3P08254 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP3P08254 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP3P08254 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP3P08254 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP3P08254 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP3P08254 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP3P08254 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP3P08254 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP3P08254 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP3P08254 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP3P08254 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP3P08254 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP3P08254 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP3P08254 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP3P08254 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP3P08254 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP3P08254 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP3P08254 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP3P08254 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP3P08254 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP3P08254 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP3P08254 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP3P08254 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP3P08254 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP3P08254 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP3P08254 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP3P08254 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP3P08254 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP3P08254 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MMP3P08254 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MMP3P08254 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MMP3P08254 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP3P08254 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP3P08254 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MMP3P08254 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP3P08254 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP3P08254 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP3P08254 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP3P08254 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP3P08254 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP3P08254 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP3P08254 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP3P08254 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP3P08254 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP3P08254 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP3P08254 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP3P08254 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP3P08254 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP3P08254 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP3P08254 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP3P08254 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP3P08254 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP3P08254 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP3P08254 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP3P08254 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP3P08254 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP3P08254 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP3P08254 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP3P08254 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP3P08254 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP3P08254 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP3P08254 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP3P08254 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP3P08254 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP3P08254 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP3P08254 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP3P08254 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP3P08254 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP3P08254 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP3P08254 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP3P08254 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP3P08254 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP3P08254 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP3P08254 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP3P08254 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP3P08254 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP3P08254 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MMP3P08254 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MMP3P08254 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP3P08254 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP3P08254 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms