Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTMAP06454 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTMAP06454 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTMAP06454 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTMAP06454 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTMAP06454 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTMAP06454 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTMAP06454 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTMAP06454 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTMAP06454 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTMAP06454 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTMAP06454 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTMAP06454 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTMAP06454 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTMAP06454 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTMAP06454 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTMAP06454 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTMAP06454 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTMAP06454 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTMAP06454 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTMAP06454 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTMAP06454 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTMAP06454 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTMAP06454 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTMAP06454 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTMAP06454 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTMAP06454 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTMAP06454 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTMAP06454 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTMAP06454 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTMAP06454 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTMAP06454 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTMAP06454 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTMAP06454 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTMAP06454 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTMAP06454 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTMAP06454 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTMAP06454 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTMAP06454 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTMAP06454 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTMAP06454 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTMAP06454 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTMAP06454 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTMAP06454 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTMAP06454 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTMAP06454 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTMAP06454 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTMAP06454 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTMAP06454 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTMAP06454 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTMAP06454 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTMAP06454 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTMAP06454 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTMAP06454 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTMAP06454 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTMAP06454 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTMAP06454 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTMAP06454 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTMAP06454 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTMAP06454 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTMAP06454 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTMAP06454 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTMAP06454 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTMAP06454 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTMAP06454 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTMAP06454 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTMAP06454 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTMAP06454 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTMAP06454 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTMAP06454 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms