Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPLP1P05386 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPLP1P05386 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPLP1P05386 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPLP1P05386 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPLP1P05386 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPLP1P05386 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPLP1P05386 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPLP1P05386 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPLP1P05386 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPLP1P05386 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPLP1P05386 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPLP1P05386 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPLP1P05386 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPLP1P05386 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms