Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNB1P01574 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms