Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F9P00740 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
F9P00740 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F9P00740 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
F9P00740 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F9P00740 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F9P00740 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F9P00740 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
F9P00740 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P00740 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P00740 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P00740 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P00740 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P00740 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P00740 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P00740 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P00740 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P00740 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P00740 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P00740 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P00740 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P00740 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P00740 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P00740 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F9P00740 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F9P00740 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F9P00740 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F9P00740 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F9P00740 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F9P00740 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F9P00740 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F9P00740 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F9P00740 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F9P00740 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F9P00740 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P00740 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P00740 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P00740 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P00740 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P00740 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P00740 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P00740 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P00740 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P00740 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P00740 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P00740 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P00740 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P00740 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F9P00740 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F9P00740 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F9P00740 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F9P00740 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
F9P00740 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F9P00740 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F9P00740 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F9P00740 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F9P00740 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F9P00740 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F9P00740 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F9P00740 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F9P00740 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F9P00740 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F9P00740 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F9P00740 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F9P00740 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
F9P00740 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P00740 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P00740 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P00740 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P00740 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P00740 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P00740 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P00740 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P00740 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P00740 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P00740 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P00740 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P00740 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P00740 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P00740 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P00740 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P00740 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P00740 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P00740 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms