Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1RP00736 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1RP00736 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1RP00736 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1RP00736 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1RP00736 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1RP00736 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1RP00736 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1RP00736 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C1RP00736 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1RP00736 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1RP00736 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1RP00736 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1RP00736 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1RP00736 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1RP00736 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1RP00736 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1RP00736 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1RP00736 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1RP00736 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1RP00736 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1RP00736 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1RP00736 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1RP00736 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1RP00736 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1RP00736 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1RP00736 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1RP00736 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1RP00736 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1RP00736 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1RP00736 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1RP00736 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1RP00736 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1RP00736 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1RP00736 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1RP00736 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1RP00736 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1RP00736 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1RP00736 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1RP00736 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1RP00736 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1RP00736 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1RP00736 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1RP00736 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1RP00736 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1RP00736 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1RP00736 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1RP00736 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1RP00736 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1RP00736 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1RP00736 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1RP00736 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1RP00736 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1RP00736 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1RP00736 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1RP00736 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1RP00736 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1RP00736 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1RP00736 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1RP00736 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1RP00736 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1RP00736 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1RP00736 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1RP00736 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1RP00736 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1RP00736 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms