Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOP3BO95985 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOP3BO95985 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOP3BO95985 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOP3BO95985 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms