Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACSL3O95573 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSL3O95573 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms