Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UFL1O94874 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UFL1O94874 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UFL1O94874 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UFL1O94874 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UFL1O94874 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UFL1O94874 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UFL1O94874 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UFL1O94874 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UFL1O94874 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UFL1O94874 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UFL1O94874 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UFL1O94874 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UFL1O94874 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UFL1O94874 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
UFL1O94874 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UFL1O94874 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UFL1O94874 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UFL1O94874 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UFL1O94874 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UFL1O94874 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UFL1O94874 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UFL1O94874 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UFL1O94874 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UFL1O94874 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UFL1O94874 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UFL1O94874 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UFL1O94874 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
UFL1O94874 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UFL1O94874 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UFL1O94874 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UFL1O94874 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UFL1O94874 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UFL1O94874 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UFL1O94874 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UFL1O94874 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UFL1O94874 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UFL1O94874 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UFL1O94874 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UFL1O94874 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UFL1O94874 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UFL1O94874 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UFL1O94874 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UFL1O94874 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UFL1O94874 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UFL1O94874 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UFL1O94874 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UFL1O94874 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UFL1O94874 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UFL1O94874 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UFL1O94874 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UFL1O94874 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UFL1O94874 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UFL1O94874 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UFL1O94874 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UFL1O94874 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UFL1O94874 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
UFL1O94874 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
UFL1O94874 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UFL1O94874 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UFL1O94874 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UFL1O94874 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UFL1O94874 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UFL1O94874 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UFL1O94874 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UFL1O94874 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
UFL1O94874 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UFL1O94874 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms