Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG12O94817 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG12O94817 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG12O94817 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG12O94817 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG12O94817 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG12O94817 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG12O94817 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATG12O94817 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG12O94817 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG12O94817 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG12O94817 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG12O94817 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG12O94817 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG12O94817 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG12O94817 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG12O94817 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG12O94817 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG12O94817 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG12O94817 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG12O94817 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG12O94817 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG12O94817 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG12O94817 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG12O94817 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG12O94817 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG12O94817 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG12O94817 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG12O94817 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG12O94817 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG12O94817 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG12O94817 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG12O94817 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG12O94817 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG12O94817 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG12O94817 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG12O94817 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG12O94817 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG12O94817 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG12O94817 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG12O94817 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG12O94817 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG12O94817 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG12O94817 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG12O94817 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG12O94817 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG12O94817 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG12O94817 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG12O94817 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG12O94817 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG12O94817 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG12O94817 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG12O94817 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms