Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP9O75884 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP9O75884 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms