Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F6O75461 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F6O75461 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F6O75461 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F6O75461 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F6O75461 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F6O75461 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F6O75461 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F6O75461 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F6O75461 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F6O75461 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F6O75461 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F6O75461 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F6O75461 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F6O75461 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F6O75461 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F6O75461 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F6O75461 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F6O75461 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F6O75461 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F6O75461 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F6O75461 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F6O75461 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F6O75461 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F6O75461 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F6O75461 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F6O75461 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F6O75461 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F6O75461 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F6O75461 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F6O75461 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F6O75461 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F6O75461 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F6O75461 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F6O75461 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F6O75461 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F6O75461 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F6O75461 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F6O75461 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F6O75461 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F6O75461 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F6O75461 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F6O75461 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F6O75461 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F6O75461 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F6O75461 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F6O75461 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F6O75461 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F6O75461 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F6O75461 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F6O75461 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F6O75461 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F6O75461 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F6O75461 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms