Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3BO75182 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms