Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB11FIP3O75154 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RAB11FIP3O75154 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms