Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIA3O75145 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIA3O75145 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms