Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL41O60662 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL41O60662 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL41O60662 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL41O60662 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL41O60662 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL41O60662 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL41O60662 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL41O60662 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL41O60662 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL41O60662 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms