Protein–RNA interactions for Protein: O60292

SIPA1L3, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L3O60292 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIPA1L3O60292 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIPA1L3O60292 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms