Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDIL3O43854 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDIL3O43854 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDIL3O43854 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDIL3O43854 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDIL3O43854 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDIL3O43854 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDIL3O43854 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDIL3O43854 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDIL3O43854 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDIL3O43854 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDIL3O43854 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDIL3O43854 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDIL3O43854 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDIL3O43854 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDIL3O43854 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDIL3O43854 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms