Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF3O43395 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms