Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA2O43364 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA2O43364 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms