Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTIFO43310 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTIFO43310 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTIFO43310 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTIFO43310 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTIFO43310 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTIFO43310 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTIFO43310 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTIFO43310 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTIFO43310 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTIFO43310 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTIFO43310 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTIFO43310 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTIFO43310 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTIFO43310 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTIFO43310 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTIFO43310 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTIFO43310 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTIFO43310 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTIFO43310 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTIFO43310 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTIFO43310 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTIFO43310 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTIFO43310 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTIFO43310 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTIFO43310 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTIFO43310 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTIFO43310 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CTIFO43310 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTIFO43310 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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