Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD3O43242 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms