Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF1O43189 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF1O43189 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF1O43189 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF1O43189 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF1O43189 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF1O43189 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF1O43189 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF1O43189 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF1O43189 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF1O43189 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF1O43189 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF1O43189 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHF1O43189 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF1O43189 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF1O43189 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF1O43189 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF1O43189 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF1O43189 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF1O43189 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF1O43189 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF1O43189 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF1O43189 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF1O43189 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF1O43189 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF1O43189 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF1O43189 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF1O43189 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF1O43189 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF1O43189 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF1O43189 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF1O43189 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF1O43189 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF1O43189 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF1O43189 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF1O43189 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF1O43189 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF1O43189 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF1O43189 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF1O43189 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF1O43189 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF1O43189 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF1O43189 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF1O43189 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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