Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHGDHO43175 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms