Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 510.6□□□□□ -0.714e-7■■■■□ 23.7
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PRPF4O43172 CDS2-204ENST00000467923 783 ntTSL 322.65■■□□□ 1.221e-7■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 CDS2-202ENST00000450570 945 ntTSL 321.91■■□□□ 1.11e-7■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 SEPT6-206ENST00000460411 1393 ntTSL 220.45■□□□□ 0.861e-7■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 EXD3-205ENST00000475006 1132 ntTSL 320.24■□□□□ 0.831e-7■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.831e-7■■■■□ 23.7
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PRPF4O43172 PKD1-205ENST00000469241 659 ntTSL 219.72■□□□□ 0.751e-7■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 PKD1-230ENST00000565639 1976 ntTSL 519.46■□□□□ 0.711e-7■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 PKD1-237ENST00000569983 722 ntTSL 519.22■□□□□ 0.671e-7■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.51e-7■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 EXD3-202ENST00000460390 1432 ntTSL 218.12■□□□□ 0.491e-7■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 EXD3-211ENST00000490886 1123 ntTSL 518.04■□□□□ 0.481e-7■■■■□ 23.7
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PRPF4O43172 PKD1-202ENST00000415938 3386 ntTSL 514.16□□□□□ -0.141e-7■■■■□ 23.7
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PRPF4O43172 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.541e-7■■■■□ 23.7
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PRPF4O43172 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.25e-8■■■■□ 23.6
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PRPF4O43172 RNF121-202ENST00000393711 608 ntTSL 513.98□□□□□ -0.177e-7■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 RNF121-207ENST00000526549 2375 ntTSL 212.92□□□□□ -0.347e-7■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.357e-7■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 RNF121-206ENST00000525243 812 ntTSL 211.61□□□□□ -0.557e-7■■■■□ 23.5
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PRPF4O43172 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.292e-7■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.182e-7■■■■□ 23.5
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PRPF4O43172 MYL6-204ENST00000546630 544 ntTSL 1 (best)14.1□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 23.5
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PRPF4O43172 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.382e-7■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.442e-7■■■■□ 23.5
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PRPF4O43172 MYL6-208ENST00000547703 675 ntTSL 511.71□□□□□ -0.532e-7■■■■□ 23.5
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PRPF4O43172 MYL6-214ENST00000549392 411 ntTSL 59.12□□□□□ -0.952e-7■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 MYL6-206ENST00000547408 683 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.952e-7■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 MYL6-217ENST00000550639 419 ntTSL 59.06□□□□□ -0.962e-7■■■■□ 23.5
PRPF4O43172 MYL6B-203ENST00000548571 223 ntTSL 48.33□□□□□ -1.082e-7■■■■□ 23.5
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