Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN3O15551 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms