Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARPC5O15511 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms