Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHADO15335 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHADO15335 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHADO15335 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHADO15335 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHADO15335 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHADO15335 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHADO15335 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHADO15335 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHADO15335 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHADO15335 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHADO15335 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHADO15335 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHADO15335 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHADO15335 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHADO15335 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHADO15335 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHADO15335 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHADO15335 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHADO15335 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHADO15335 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHADO15335 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHADO15335 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHADO15335 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHADO15335 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHADO15335 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHADO15335 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHADO15335 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHADO15335 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHADO15335 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHADO15335 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHADO15335 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHADO15335 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHADO15335 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHADO15335 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHADO15335 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHADO15335 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHADO15335 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHADO15335 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHADO15335 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHADO15335 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHADO15335 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHADO15335 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHADO15335 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHADO15335 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHADO15335 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHADO15335 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHADO15335 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHADO15335 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHADO15335 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHADO15335 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHADO15335 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms