Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IKBKBO14920 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms