Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP3O14828 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms