Protein–RNA interactions for Protein: O14745

SLC9A3R1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R1O14745 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3R1O14745 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3R1O14745 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3R1O14745 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3R1O14745 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3R1O14745 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A3R1O14745 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A3R1O14745 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A3R1O14745 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A3R1O14745 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A3R1O14745 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A3R1O14745 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms