Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAFD1O14545 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAFD1O14545 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms