Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRTO14522 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRTO14522 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
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