Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms