Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE2AO00408 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE2AO00408 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms