Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3FO00303 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EIF3FO00303 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms