Protein–RNA interactions for Protein: O00292

LEFTY2, Left-right determination factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEFTY2O00292 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LEFTY2O00292 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEFTY2O00292 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms