Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1FO00160 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms