Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPSO00116 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPSO00116 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPSO00116 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPSO00116 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPSO00116 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPSO00116 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPSO00116 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPSO00116 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPSO00116 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPSO00116 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPSO00116 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPSO00116 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPSO00116 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPSO00116 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPSO00116 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPSO00116 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPSO00116 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPSO00116 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGPSO00116 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPSO00116 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPSO00116 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPSO00116 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPSO00116 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPSO00116 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPSO00116 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPSO00116 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPSO00116 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPSO00116 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPSO00116 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPSO00116 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPSO00116 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPSO00116 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPSO00116 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPSO00116 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPSO00116 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPSO00116 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPSO00116 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPSO00116 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPSO00116 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPSO00116 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPSO00116 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPSO00116 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPSO00116 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPSO00116 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPSO00116 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPSO00116 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPSO00116 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPSO00116 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPSO00116 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPSO00116 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPSO00116 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPSO00116 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPSO00116 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPSO00116 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPSO00116 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPSO00116 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPSO00116 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPSO00116 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPSO00116 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPSO00116 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPSO00116 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPSO00116 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPSO00116 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPSO00116 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPSO00116 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPSO00116 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPSO00116 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPSO00116 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPSO00116 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGPSO00116 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGPSO00116 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGPSO00116 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGPSO00116 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGPSO00116 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGPSO00116 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGPSO00116 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGPSO00116 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPSO00116 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPSO00116 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPSO00116 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPSO00116 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPSO00116 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPSO00116 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPSO00116 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPSO00116 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPSO00116 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPSO00116 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPSO00116 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPSO00116 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPSO00116 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPSO00116 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPSO00116 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPSO00116 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPSO00116 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPSO00116 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPSO00116 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPSO00116 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPSO00116 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPSO00116 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms