Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H7C1H1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H7C1H1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H7C1H1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H7C1H1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H7C1H1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H7C1H1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H7C1H1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H7C1H1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H7C1H1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H7C1H1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H7C1H1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H7C1H1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H7C1H1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H7C1H1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H7C1H1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H7C1H1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H7C1H1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H7C1H1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H7C1H1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H7C1H1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H7C1H1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H7C1H1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H7C1H1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H7C1H1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H7C1H1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H7C1H1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H7C1H1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H7C1H1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H7C1H1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H7C1H1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H7C1H1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H7C1H1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H7C1H1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H7C1H1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H7C1H1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H7C1H1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H7C1H1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H7C1H1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms